連續(xù)色調(diào)的圖像是模擬的光學(xué)和電子設(shè)備，通過多種方法，如電信號波動或圖像中的所有尺寸不斷變化的膠片感光乳劑的化學(xué)性質(zhì)的變化序列，準(zhǔn)確記錄圖像數(shù)據(jù)。在連續(xù)音或模擬圖像進行處理，或由計算機顯示的順序，它必須首先被轉(zhuǎn)換成計算機可讀形式或數(shù)字格式。此過程適用于所有顯微鏡圖像，無論起源和復(fù)雜性，以及他們是否存在黑白（灰度）或全彩色。數(shù)字圖像是由一個長方形（或正方形）像素代表了一系列強度值的數(shù)組，并下令通過一個有組織的（X，Y）坐標(biāo)系。

由于圖像尺寸一般在正方形或長方形，每個像素，從圖像的數(shù)字化的結(jié)果是由一個特定的x和y值安排在一個典型的直角坐標(biāo)系的坐標(biāo)對代表。 x坐標(biāo)指定的水平位置或列的像素的位置，而y坐標(biāo)表示的行號或垂直位置。

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